基因芯片数据进阶分析


在常规的基因芯片数据基础上,我们提供跨平台基因芯片整合分析、多批次基因芯片比较、自定制图表绘制、差异基因列表挖掘等进阶分析服务。

跨平台基因芯片整合分析可以将不同规格、不同类型的基因芯片结果进行一并分析,将多次基因芯片实验结果进行联合分析,得出单次芯片实验无法得出的有价值结论。例如,研究组得到了其他研究团队对同一研究对象的基因基因芯片数据,但是两次芯片的规格不一样。原本的基因芯片是基于NimbleGen全基因组表达谱芯片,而对方实验室采用的是Affymetrix五合一基因芯片。两种芯片的探针设计、探针编号完全不一致,给出的数据分析结果格式内容也存在较大差别。此时,一般研究者只能对两个芯片的数据最终差异基因结果进行比较,而无法从数据一致度上比较两次实验,从而错过了很多极为有价值的信息。

多批次基因芯片比较是针对在不同批次完成的多次基因芯片结果,这些样品的处理条件一致,但是由于是分多次完成基因芯片实验。由于不同实验间存在实验操作和技术重复的问题,芯片实验的结果不能直接进行比较。我们通过多批次基因芯片数据校正算法对结果进行校正,然后得到可以相互比较的数据,从而使得多次芯片实验作为整体进行分析。

许多复杂的图表无法直接通过现有软件进行绘制,需要借助绘图编程等高级工具才能完成。自定制图表绘制是根据客户想法或已发表论文的相关参考样例进行定制的图表绘制,作出理想漂亮的图表。

虽然基因芯片技术已经相对成熟,但是常规分析方法较为简单直接,忽略了基因芯片数据中许多信息。我们可以根据客户具体芯片实验的设计意图、芯片类型、数据质量等因素综合考虑,对数据做最有效的分析,得出更具价值的结论。


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